ANALISIS KERAGAMAN GENETIK IKAN PARI (Mobula sp.) DI CILACAP DENGAN PENANDA RAPD (RANDOM AMPLIFIED POLYMORPHIC DNA)
No Thumbnail Available
Date
2023-05-23
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
Alda Awayan Banjarsari. (Dibimbing oleh: Yuniar Mulyani dan Izza Mahdiana Apriliani). 2023. Analisis Keragaman Genetik Ikan Pari (Mobula sp.) di Cilacap dengan Penanda RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA).
Ikan pari (Mobula sp.) berada pada status endangered sehingga perlu dilakukannya langkah konservasi. Salah satu langkah awal, perlu diadakan identifikasi tingkat keragaman genetik. Tujuan dari penelitian ini untuk menentukan keragaman genetik ikan pari di Cilacap berdasarkan pita-pita DNA polimorfisme primer penanda genetik RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). Metode penelitian ini adalah survei dengan analisis deskriptif kuantitatif yang didapatkan dari perhitungan kemurnian DNA serta data kualitatif didapatkan dari kemunculan pita yang tervisualisasi dari hasil elektroforesis amplifikasi DNA. Prosedur dilakukan dengan preservasi sampel ikan pari, isolasi DNA sampel, elektroforesis hasil isolasi DNA, menghitung kemurnian DNA, amplifikasi DNA, elektroforesis hasil amplifikasi DNA, serta pengolahan dan analisis data. Isolasi DNA dilakukan dengan metode Kit Promega, apabila isolasi DNA tidak terlihat pada elektroforesis maka dilakukan dengan cara metode CTAB Modifikasi. Primer yang paling polimorfik adalah OPE-01 dengan jumlah pita polimorfik sebanyak 10 dari 20 pita yang tervisualisasi. Indeks kesamaan tertinggi adalah primer OPK-08 yaitu 75% dari CIL-10 terhadap CIL-13. Indeks kesamaan terendah adalah CIL-10 terhadap CIL 13 sebesar 33% dari primer OPC-20. Rerata indeks kesamaan tersebut menunjukan bahwa keragaman genetik dari spesies Mobula adalah sedang. Berdasarkan primer OPE-01 dan OPC-20 spesies M. thurstoni dan M. mobular lebih dekat daripada dengan M.tarapacana. Berdasarkan primer OPK-11 dan OPK-08 M. mobular dan M. tarapacana lebih dekat daripda dengan M. thrustoni
Description
Keywords
Amplifikasi, CTAB, M. Mobular