Kenakearagaman Bakteri Pada Terumbu Karang Acropora sp. di Pulau Biawak, Indramayu
No Thumbnail Available
Date
2018-10-05
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
Syafira Prisentrai (Dibimbing oleh: M. Wahyudin Lewaru dan Sunarto). 2018. Keanekaragaman Bakteri pada Terumbu Karang Acropora sp. di Pulau Biawak, Indramayu.
Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keanekaragaman komunitas bakteri pada jaringan terumbu karang Acropora sp. di perairan Pulau Biawak, Kabupaten Indramayu, Jawa Barat, secara molekuler dengan metode NGS (Next Generation Sequencing) Illumina. Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Juli 2017 – Februari 2018 di Laboratorium Bioteknologi Terpadu, FPIK, Unpad. Pengambilan sampel karang dilakukan pada 5 Mei 2017 di perairan Pulau Biawak pada dua stasiun berbeda. DNA genom bakteri diisolasi dengan menggunakan Zymobiomics DNA Mini Kit Cat. D4300 dan disequencing dengan NGS (Next Generation Sequencing) Illumina menggunakan primer 16s V3-V4 region 341F dan 805R. Data sequence diolah dengan perangkat lunak MG-Rast dan dicocokan dengan database RNA milik RDP. Hasil identifikasi menunjukan total genus yang terdeteksi dari keempat sampel adalah sejumlah 93 genus dari 59 famili 29 ordo 14 kelas dan 7 filum dengan percent identify 97% dan e-value 1. Bakteri Alphaproteobacteria (36,0%), Bacilli (13,0%), bakteri Unclassified (40,8%) merupakan bakteri yang terdapat di semua sampel dengan kelimpahan relatif yang tinggi. Tingkat keanekaragaman jenis bakteri tergolong sedang pada kedua stasiun. Variabilitas komposisi dan keanekaragaman komunitas bakteri pada kedua stasiun dapat dipengaruhi oleh kondisi lingkungan perairan seperti suhu, salinitas, DO, pH, dan arus di sekitar ekosistem terumbu karang.
Kata kunci: Acropora sp., Bakteri, Metagenom, NGS, Pulau Biawak
Description
Keywords
Keanekaragaman, Bakteri, Acropora sp.