Isolasi dan Karakterisasi Gen Penyandi Enzim Agarase dari Isolat GC21 untuk Menunjang Produksi Bioetanol dari Rumput Laut
No Thumbnail Available
Date
2014-08-12
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
Sherly Intan Amalia (Dibimbing oleh : Santi Rukminita Anggraeni dan Mochamad Untung Kurnia Agung) 2014. Isolasi dan Karakterisasi Gen Penyandi Enzim Agarase dari Isolat GC21 untuk Menunjang Produksi Bioetanol dari Rumput Laut.
Agarase merupakan enzim yang berperan dalam proses pemecahan agar menjadi monomer-monomer sederhana yang salah satunya diperlukan dalam proses sakarifikasi rumput laut sebagai bahan baku etanol. Sumber penghasil enzim agarase salah satunya dari bakteri yang diisolasi dari rumput laut yaitu Microbulbifer sp. Penelitian ini dilakukan pada bulan Januari-Juni 2014 di Laboratorium Bioteknologi Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan Universitas Padjadjaran. Tujuan dilaksanakannya penelitian ini yaitu mendesain primer spesifik untuk mendapatkan sekuen gen penyandi agarase dari isolat GC21 serta mengisolasi dan mengkarakterisasi gen penyandi enzim agarase dari isolat GC21. Penelitian ini dilakukan dengan menggunakan metode eksploratif dan data yang diperoleh dianalisis secara deskriptif. Sepasang primer gen penyandi enzim agarase isolat bakteri GC21 yang sesuai dengan syarat primer pada umumnya berhasil didesain secara degenerate dengan menggunakan program CODEHOP, produk hasil PCR gen agarase sepanjang 1077 bp dan menunjukkan kemiripan sebesar 79% dengan Microbulbifer thermotolerans. Hasil karakterisasi In silico menunjukkan bahwa sekuen gen yang diperoleh dari hasil PCR mempunyai domain fungsional GH_16_beta_agarase dan DUF2502; sisi aktif RICIN_B_LECTIN; serta motif ASN_GLYCOSYLATION MYRISTYL, PRO_RICH, dan RICIN_B_LECTIN yang menunjukkan peluang terekspresinya enzim agarase khususnya β-agarase bila dilakukan proses ekspresi gen.
Description
Keywords
Agarase, Microbulbifer sp, PCR