Analisis Potensi Bakteri Kitinolitik Asal Limbah Udang dan Kepiting Kandidat Penghasil Enzim Kitinase serta Anti Jamur Saprolegnia sp. Menggunakan Marka Molekuler Gen 16S rRNA
No Thumbnail Available
Date
2013-07-26
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
ABSTRAK
Hanif Sri Wahyuni Agustin (Dibawah Bimbingan: Ibnu Dwi Buwono dan Roffi Grandiosa). 2013. Analisis Potensi Bakteri Kitinolitik Asal Limbah Udang dan Kepiting Kandidat Penghasil Enzim Kitinase serta Anti Jamur Saprolegnia sp. Menggunakan Marka Molekuler Gen 16S rRNA.
Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Februari 2013 sampai dengan Mei 2013 di Laboratorium Bioteknologi Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan Universitas Padjadjaran serta lokasi pengambilan sampel limbah udang dan kepiting di sekitar PPN Kejawanan Cirebon. Target penelitian adalah mencari bakteri kitinolitik asal limbah udang dan kepiting yang dapat menghambat pertumbuhan jamur Saprolegnia sp. Metode penelitian menggunakan analisis deskriptif terhadap parameter uji, identifikasi molekuler gen 16S rRNA dan aktivitas kitinolitik. Pengerjaan penelitian ini meliputi empat tahap, yaitu kultivasi bakteri, uji aktivitas kitinolitik, uji aktivitas anti jamur Saprolegnia sp., dan analisis molekuler gen 16S rRNA serta fragmen penyandi kitinase. Kultivasi bakteri mencakup isolasi bakteri, pemurnian bakteri, dan identifikasi pewarnaan gram. Hasil uji aktivitas kitinolitik bakteri asal limbah udang dan kepiting yang memiliki indeks kitinolitik tertinggi masing-masing 2, 12 mm dan 1,99 mm. Sedangkan hasil uji aktivitas anti jamur Saprolegnia sp. diperoleh zona hambat dari bakteri asal limbah udang dan limbah kepiting masing-masing 6,005 mm dan 11,59 mm. Hasil analisis sekuen gen 16S rRNA dan gen penyandi kitinase menggunakan program BLASTN dan BLASTX pada amplifikasi bakteri limbah udang dan kepiting (1153 bp) masing-masing memiliki keidentikan 96 % dengan Bacillus thuringiensis (no aksesi YP 003665928.1) dan 99 % identik dengan Bacillus cereus (no aksesi WP 000932552.1)
Kata kunci : anti Saprolegnia sp., bakteri kitinolitik, limbah udang dan kepiting,
16S rRNA
Description
Keywords
anti Saprolegnia, bakteri kitinolitik, 16S rRNA