Prediksi Aktivitas Tanin Ekstrak Gambir Terhadap Protein Muramidase A dan Glucosyltransferase B Streptococcus mutans Secara In Silico
No Thumbnail Available
Date
2022-10-14
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
Karies gigi merupakan penyakit mulut yang bersifat multifaktorial. Streptococcus mutans merupakan salah satu bakteri gram positif patogen penyebab karies gigi. Streptococcus mutans merupakan bakteri gram positif yang memiliki dinding sel tersusun dari peptidoglikan. Biosintesis peptidoglikan dipengaruhi oleh enzim muramidase A. Enzim Muramidase A merupakan enzim yang sangat penting pada Streptococcus mutans dalam pembentukan dinding sel. Streptococcus mutans dapat menghasilkan enzim Glucosyltransferase yang mampu mensintesis berbagai glukan mendukung perlekatan bakteri untuk kolonisasi awal pembentukan plak gigi. Gambir merupakan tanaman yang banyak tumbuh di negara tropis seperti Indonesia. Penelitian yang telah ada sebelumnya menunjukkan tanin yang berasal dari tanaman seperti gambir memiliki aktivitas antimikroba. Penelitian ini bertujuan menganalisis prediksi aktivitas senyawa tanin dari ekstrak Gambir terhadap enzim Muramidase A dan Glucosyltransferase B Streptococcus mutans dengan metode in silico. Prediksi Aktivitas tanin dibandingkan dengan khlorheksidin sebagai kontrol dengan menggunakan in silico. Struktur ligan (tanin dan klorheksidin) yang didapatkan dari Pubchem dan struktur enzim (Muramidase A dan Glucosyltransferase B) didapatkan dari RSCB. Molecular docking dilakukan menggunakan alat Autodock 1.5.6 dan di visualisasi menggunakan Discovery Studio 2020 Client. Berdasarkan hasil metode in silico tanin memiliki binding affinity -6.07 kcal/mol terhadap enzim Muramidase A dan memiliki binding affinity -5.15 kcal/mol terhadap Glucosyltransferase B dan mendekati khlorheksidin yaitu -6.17 kcal/mol pada Muramidase A dan -7.26 kcal/mol pada Glucosyltransferas B. Tanin maupun klorheksidin memiliki ikatan hidrogen dengan perlekatan asam amino yang sama Hal ini menunjukkan adanya aktivitas antara molekul senyawa aktif tanin yang terdapat dalam ekstrak Gambir terhadap enzim Muramidase A dan enzim Glucosyltransferase B Streptococcus mutans dan bisa dijadikan alternatif pengganti khlorheksidin sebagai anti mikroba yang kompetitif dalam pencegah karies.
Description
Keywords
Streptococcus mutans, Muramidase A, Glucosyltransferase B