SIMULASI DINAMIKA MOLEKULAR RESEPTOR ESTROGREN DENGAN TAMOKSIFEN DAN TURUNAN KALKON SEBAGAI ANTI KANKER PAYUDARA
No Thumbnail Available
Date
2017-11-24
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
Kanker payudara salah satu penyebab kematian wanita terbanyak di dunia. Senyawa turunan kalkon (KLN), 2’,4’-dihidroksi-6-metoksi-3,5-dimetilkalkon dapat menghambat proliferasi sel MCF-7 yang merupakan basis sel kanker payudara, dengan nilai IC50 sebesar 74,5 μg/mL (250 μM). Tetapi nilai IC50 tersebut masih menunjukkan aktivitas yang lemah. Aktivitas dapat ditingkatkan dengan cara memodifikasi struktur senyawanya. Dalam penelitian ini, struktur KLN dimodifikasi untuk meningkatkan afinitasnya terhadap reseptor estrogen dengan pendekatan simulasi komputasi, secara doking molekuler dan dinamika molekuler pada reseptor agonis hER-α (PDB ID 3ert). Hasil doking molekuler modifikasi KLN yang memiliki gugus fenol dan pirazol (MK20) memiliki nilai energi ikatan bebas (ΔG) sebesar -11,9 kkal/mol dan membentuk ikatan hidrogen dengan GLU353 dan ARG394, sedangkan tamoksifen memiliki nilai -11,4 . Kemudian, dilakukan simulasi dinamika molekuler untuk menentuan nilai energi ikatan menggunakan metode kalkulasi MMPBSA (Molecular Mechanics Poisson-Boltzmann and Surface Area). MK20 memiliki afinitas lebih baik dibanding kalkon dengan nilai ΔGTotal= -50,713 kkal/mol, sedangkan tamoksifen sebesar -50,541 kkal/mol.
Kata kunci: Kanker payudara, Kalkon, Doking molekuler, Dinamika molekuler, Reseptor estrogen α
Description
Keywords
In Silico, Kimia Komputas, Doking