3D QSAR PHARMACOPHORE SENYAWA TURUNAN ASAM HIDROXAMAT SEBAGAI INHIBITOR TUMOR NECROSIS FACTOR ALPHA (TNF-α)
No Thumbnail Available
Date
2014-08-20
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
Ekspresi yang berlebihan dari Tumor Necrosis Factor alpha (TNF-α) yang merupakan sitokin proinflamasi 17 kDa, berkaitan langsung dengan penyakit inflamasi seperti rheumatoid arthritis dan penyakit Chron’s. Fitur kimia berdasarkan model 3D QSAR farmakofor telah dikembangkan terhadap senyawa turunan asam hidroxamat sebagai inhibitor TNF-α. Model tiga dimensi farmakofor dibentuk menggunakan program Discovery Studio 2.5, untuk mengetahui fitur – fitur pada senyawa turunan asam hidroxamat yang bertanggung jawab menginhibisi TNF-α. Tahap-tahap pemodelan farmakofor yaitu penyiapan data yang mencakup penggambaran 2D dengan ChemDraw Ultra, optimasi geometri dengan Hyperchem 7.0, Common Feature Generation Pharmacophore dengan perangkat lunak Discovery Studio, pembuatan training set, pharmacophore generation dengan 3D QSAR Pharmacophore, analisis data, dan validasi model. Model farmakofor terbaik (Hipotesis 1) yang terdiri dari satu hydrogen bond donor, satu hydrogen bond acceptor, dan dua hidrofobik, telah dihasilkan dari 28 senyawa training set.
Description
Keywords
Asam Hidroxamat, Farmakofor, Inhibitor TNF-α