S1 - Sarjana

Permanent URI for this community

Now showing 1 - 1 of 1

SIMULASI DOCKING MOLEKULER BEBERAPA SENYAWA KIMIA BAHAN ALAM TERHADAP NEURAMINIDASE TIPE N1
(2014-08-21) ADI ALIYUDIN; Tidak ada Data Dosen; Tidak ada Data Dosen
Simulasi docking molekuler merupakan suatu metode dalam upaya pengembangan inhibitor neuraminidase N1 dan N1 mutan. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui interaksi, konformasi ikatan, dan afinitas ikatan yang terjadi pada beberapa senyawa kimia bahan alam terhadap neuraminidase tipe N1 dan N1 mutan dengan menggunakan program Autodock 4.2. Validasi metode dan program simulasi docking molekuler dilakukan dengan metode redocking zanamivir terhadap neuraminidase tipe N1 dan dilakukan plot nilai log IC50 senyawa turunan asam sialat terhadap nilai log Ki hasil simulasi docking molekuler. Simulasi docking molekuler dilakukan terhadap 115 senyawa kimia bahan alam dan zanamivir serta oseltamivir sebagai ligan standar. Hasil penelitian menunjukkan bahwa inhibitor neuraminidase N1 maupun N1 mutan terbaik dari senyawa kimia bahan alam yaitu katsumadain A. Katsumadain A memiliki ikatan hidrogen dengan residu asam amino Arg118 dan Arg371 pada neuraminidase, sedangkan pada neeurainidase N1 mutan katsumadain A hanya memiliki satu ikatan hidrogen dengan Arg118.