Bakteri Penghasil Enzim Dan Gen Penyandi Selulase Yang Berasal Dari Rumput Laut Eucheuma sp., Gracilaria sp., Sargassum sp.
No Thumbnail Available
Date
2014-03-09
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
ABSTRAK
Mauli Dian Pertiwi (Dibimbing Oleh: Ayi Yustiati dan Iskandar). 2014.
Bakteri Penghasil Enzim dan Gen Penyandi Selulase Berasal dari Rumput
Laut Eucheuma sp., Gracilaria sp., Sargassum sp.
Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan isolat murni bakteri
selulolitik dari rumput laut yang berpotensi sebagai penghasil enzim selulase,
mengidentifikasi jenis bakteri menggunakan marka molekuler gen 16S rRNA dan
mengkarakterisasi gen penyandi selulase dari isolat bakteri tersebut. Sampel
rumput laut Eucheuma sp berasal dari perairan Cantigi, Indramayu dan sampel
Gracilaria sp serta Sargassum sp berasal dari perairan Sancang, Garut. Penelitian
dilaksanakan di Laboratorium Mikrobiologi dan Bioteknologi, Fakultas Perikanan
dan Ilmu Kelautan, Universitas Padjadjaran. Metode penelitian adalah analisis
deskriptif dengan membandingkan hasil identifikasi molekuler gen 16S rRNA dan
gen penyandi selulase dengan sekuen dari data GeneBank. Tahapan penelitian
meliputi isolasi dan pemurnian bakteri, uji indeks selulolitik dengan CMC, uji
gula pereduksi menggunakan metode Somogyi-Nelson, analisis molekuler gen
16S rRNA serta fragmen gen penyandi selulase dan analisis bioinformatika. Hasil
penelitian menunjukkan indeks selulolitik pada isolat bakteri dari Eucheuma sp
sebesar 1.02 mm, isolat bakteri dari Gracilaria sp sebesar 2.11 mm dan isolat
bakteri dari Sargassum sp sebesar 1.89 mm. Hasil identifikasi molekuler
menggunakan gen 16S rRNA homolog dengan sekuen bakteri Oceanobacillus sp
dan Bacillus cereus dan hasil verifikasi sekuen penyandi selulase yang berasal
dari bakteri di rumput laut homolog dengan Bacillus subtilis BSn5, Bacillus
subtilis dan Bacillus amyloliquefaciens. Karakterisasi gen penyandi selulase dari
bakteri Bacillus subtilis BSn5, Bacillus subtilis dan Bacillus amyloliquefaciens
memiliki domain katalitik Glyco Hydrolase 5 (GH 5) dan domain Carbohidrate
binding modul tipe 3 (CBM3).
Kata kunci: Eucheuma sp, Gracilaria sp, Sargassum sp, Bakteri Selulolitik,
16S rRNA, Selulase
Description
Keywords
Eucheuma sp, Gracilaria sp, Sargassum sp