STUDI PIRAMIDISASI GEN TAHAN VIRUS Ty-1, Ty-5 DAN Ty-6 DALAM POPULASI BC4F1 TANAMAN TOMAT (Solanum lycopersicum L.) BERBASIS MARKA MOLEKULER DAN MORFOLOGI
No Thumbnail Available
Date
2021-02-22
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
Perakitan genotip tomat melalui kegiatan piramidisasi gen Ty diharapkan dapat menggabungkan beberapa kombinasi gen Ty yang mampu meningkatkan ketahanan terhadap serangan TYLCV di lapangan. Penelitian ini bertujuan untuk melihat kombinasi gen Ty dari BC4F1 hasil piramidisasi beserta dengan tetua reccurent dan donor dengan bantuan penanda molekuler. Genotip BC4F1 hasil piramidisasi kemudian dianalisis molekuler menggunakan marka CAPS TG231, CAPS SINAC1 untuk identifikasi gen Ty-1 dan Ty-5 beserta dengan enzim restriksi Taq1 1U DreamTaq DNA Polymerase (Thermo Fisher Scientific, USA) dan marka SSR SLM10-46 untuk identifikasi gen Ty-6, serta karakterisasi fenotip terhadap karakter agronomi dan karakter karakter preferensi vektor kutu kebul untuk mengetahui karakter yang tersekspresi dibandingkan dengan tetua reccurentnya. Data yang diperoleh selanjutnya dianalisis korelasi untuk mengetahui keeratan hubungan antara marka molekuler dengan fenotip. Pada penelitian ini diperoleh sebelas genotip yaitu genotip #45, #46, #50, #54, #76, #86, #90, #93, #97, #105, #122 yang memiliki karakter tebal daging, panjang buah, jumlah cabang, hasil pertanaman, bobot per buah, kekerasan buah, tinggi tanaman, jumlah buah, diameter buah dan jumlah tandan buah yang paling baik serta genotip #23, #32, #44, #49, #95 memiliki karakter jumlah trikoma, luas daun, jumlah stomata dan tebal daun yang paling baik dibanding dengan tetua reccurentnya. Korelasi matrix yang kuat antara marka molekuler dengan marka fenotip dihasilkan pada karakter ketahanan (preferensi vektor kutu kebul) dengan nilai koefisen korelasi (r (AB) = 0.081; P < 0.0001) tetapi tidak berkorelasi dengan gabungan tiga belas marka fenotip karakter agronomi dengan nilai koefisen korelasi (r (AB)= -0.015; P = 0.208) berdasarkan uji Mantel. Korelasi yang nyata antara marka molekuler dengan gabungan empat karakter preferensi kutu kebul menunjukkan bahawa marka molekuler yang digunakan menjadi acuan dalam mendeteksi gen target Ty.
Description
Keywords
Marka molekuler, marka fenotip, tomat