KAJIAN IN SILICO SENYAWA ANTIDEPRESAN DARI BAHAN ALAM TERHADAP ENZIM MONOAMIN OKSIDASE A
No Thumbnail Available
Date
2013
Authors
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Abstract
Depresi merupakan salah satu bentuk gangguan alam perasaan. Dewasa ini telah banyak ditemukan senyawa bahan alam yang berpotensi sebagai antidepresan. Penelitian ini dilakukan untuk memprediksi interaksi senyawa tersebut dengan monoamin oksidase menggunakan metode simulasi docking. Target yang dievaluasi merupakan PLANTSscore,ikatan hidrogen dan ikatan phi. Program yang digunakan adalah PLANTS (Protein Ligand Ant System) dengan menggunakan 10 konformasi ligan. Ligan yang digunakan sebanyak 42 ligan termasuk ligan asli (harmin)yang terdapat dalam protein dengan perolehan nilai RSMD 0,7599. Setiap Ligan kemudian didocking pada enzim monoamine oksidase A dengan kode PDB 2Z5X dengan menggunakan 2 metode yakni MAO-A yang mengandung air dan tanpa air. PLANTSscore untuk ligan asli harmin pada metode pertama dan kedua yakni -72,532 dan -77,123. Sekitar sembilan ligan yakni harmaline, Jatamansone, Oroselol, Quercetin, apigenin, luteolin, Catechin, epicatechin, dan eugenol menunjukkan PLANTSscore yang mendekati score ligan asli dan interaksi hidrogen yang mirip dengan interaksi ligan asli. Adanya air membuat PLANTSscore menjadi lebih tinggi dibanding tanpa air. Phe208, Gln215, Cys323, Tyr407, dan Tyr444 merupakan residu dalam binding site yang banyak berinteraksi dengan ligan.
Description
Keywords
In Silico, Antidepresan, Bahan Alam