Perikanan (S1)
Permanent URI for this collection
Browse
Browsing Perikanan (S1) by Author "AHMAD FIKRY DIANI"
Now showing 1 - 1 of 1
Results Per Page
Sort Options
Item Analisis Kekerabatan Strain Lele (Clarias Spp.) Menggunakan Penanda Genetik Berbasis RAPD-PCR(2013-07-23) AHMAD FIKRY DIANI; Tidak ada Data Dosen; Tidak ada Data DosenMetode RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) telah digunakan untuk mengetahui tingkat kekerabatan ikan lele Lokal, Dumbo, Sangkuriang, dan Albino dari beberapa daerah. Penelitian ini menggunakan metode survey dengan analisis deskriptif kualitatif di laboratorium. DNA dari ikan uji lele Lokal, Dumbo, Sangkuriang, dan Albino diisolasi menggunakan kit. Dari 8 primer yang dicobakan, amplifikasi DNA menggunakan primer OPA-03 (5’-AGTCAGCCAC-3’) dan OPA-09 (5’- GGGTAACGCC-3’) menghasilkan pita polimorfik terbaik. Hasil visualisasi DNA dari kedua primer menunjukan pola-pola larik polimorfik dan monomorfik. Pola larik tersebut diterjemahkan ke dalam bentuk data numerik (1/0) dan untuk mengetahui hubungan kekerabatan digunakan pohon filogenik (fenogram) yang dibuat dengan menggunakan program NTSYS-pc. Hasil fenogram secara umum dari kedua primer dan penggabungan primer diperoleh 3 kelompok besar yang terdiri dari lele Lokal, Dumbo, dan Sangkuriang. Kekerabatan ikan lele Lokal dengan lele uji lainnya memiliki indeks kesamaan berkisar 41%. Selanjutnya kelompok ikan lele Dumbo dengan ikan lele Sangkuriang memiliki kekerabatan dekat dengan indeks kesamaan berkisar 58,33%. Kelompok terakhir yang terdiri dari kelompok ikan lele Sangkuriang Garut, Sangkuriang Sumedang, Sangkuriang Tasikmalaya, dan lele Albino memiliki hubungan yang dekat dengan nilai indeks kesamaan 62,5%. Primer OPA-03 lebih sensitif untuk mendeteksi hubungan kekerabatan ikan lele Lokal, Dumbo, Sangkuriang, dan Albino.